因此，兇手很快就被揪了出來。事情也就此了結(jié)了，但等到柯南回到家后，小蘭就告訴他，自從放寒假英祐就失去了聯(lián)絡(luò)，而在此之前，小蘭從他那里聽說他好像在杯戶中央醫(yī)院找姐姐的時(shí)候發(fā)現(xiàn)了關(guān)于自己父親的線索，柯南急忙找茱蒂老師商量對(duì)策，并推斷出他的父親就是被黑暗組織殺掉的CIA諜報(bào)人員。隨后，柯南一行人趕往醫(yī)院，向護(hù)士詢問英祐的事情，沒想到竟然還有另外一個(gè)人，像英祐一樣在這家醫(yī)院打聽水無玲奈的事情。

柯南根據(jù)調(diào)查，從一位老護(hù)士口中得知，他以前見過英祐并且在他小的時(shí)候還因白血病做過手術(shù)。另一方面，得知杯戶中央醫(yī)院被黑暗組織入侵后，柯南和FBI立刻對(duì)醫(yī)院的病人進(jìn)行排查，其中最具嫌疑的，有三個(gè)人未找出那個(gè)在醫(yī)院調(diào)查水無玲奈的人，柯南想出了一條妙計(jì)，他直接與這三個(gè)嫌疑人接觸，最終將目標(biāo)鎖定。

于是，柯南還有赤井一直偷偷跟在這名潛入醫(yī)院的黑暗組織同伙南田陸道身后。剛完南田陸道，果然展開了行動(dòng)，但同時(shí)FBI也暴露了行動(dòng)，南田陸道在驅(qū)車逃跑的過程中，舉槍自盡。雖然柯南破壞了他的電話，但他還是通過其他手段將收集來的信息傳給了組織。既然事情發(fā)展到這種地步，轉(zhuǎn)院無疑就是向黑暗組織召示水無憐奈就在這里，所以只能另想對(duì)策。另一方面，英祐伺機(jī)潛入水無憐奈的房間，并發(fā)現(xiàn)她早已從昏迷中蘇醒。在FBI制定作戰(zhàn)計(jì)劃的同時(shí)，黑暗組織就已經(jīng)展開了行動(dòng)，他們以南田陸道的名義寄給FBI一盆花，就在柯南推測敵人的意圖時(shí)，杯戶中央醫(yī)院突然涌來大波病患，這無疑也是黑衣組織的安排，在處理完花盆里埋的炸彈后，醫(yī)院陸續(xù)的出現(xiàn)送貨員，而這些貨物全部都是黑暗組織送的炸彈，如果醫(yī)院爆炸后果不堪設(shè)想。

FBI的所有警員立刻將送至各個(gè)病房的炸彈進(jìn)行回收，就在這時(shí)，水無憐奈出現(xiàn)在電視上，為一探究竟，所有搜查員都聚集到水無憐奈的房間，卻發(fā)現(xiàn)她好好的躺在那里，而這其實(shí)才是黑衣組織的目的，他們?cè)谡◤椛线€安裝了發(fā)信器，這樣一來水無憐奈的位置一目了然。既然已經(jīng)暴露了，那就只能立刻將她轉(zhuǎn)移，為了混淆視聽，F(xiàn)BI派出了三輛車，但即便如此琴酒是做出了判斷。琴酒鎖定目標(biāo)，就在他們準(zhǔn)備行動(dòng)時(shí)，水無憐奈突然蘇醒，并將FBI駕駛員打暈逃回了黑暗組織。然而，這一切都是柯南和赤井秀一所設(shè)下的陷阱，柯南早就察覺到英祐在這家醫(yī)院，并利用他將水無喚醒，之后柯南又戳破了水無是CAI的諜報(bào)人員的真實(shí)身份。既然自己的身份暴露了，水無便答應(yīng)了FBI重新潛入黑暗組織的要求，但條件是他們要保護(hù)好自己的弟弟。

未完待續(xù)