作者在都市內(nèi)出現(xiàn)了連續(xù)女性被殺事件。經(jīng)警察調(diào)察，犯案者是異形怪物，而主角風祭真因為一直發(fā)著相關事件的夢而備受困擾……真的父親是遺傳學研究所里的科學家。而真則自愿成為了研制不治之病的實驗品，但卻被瘋狂的科學家鬼冢義一實行的現(xiàn)階段最危險的生化實驗·Lv.3的遺傳因子操作實驗而變成了生化戰(zhàn)士假面騎士Shin。但鬼冢最大的目的就是要將真供幕后BOSS“財團”作為軍事武器。真最后逃出了“財團”的魔掌，并且與“財團”的改造士兵Lv.2·豪島展開生死之戰(zhàn)！