清朝雍正年間，在云貴地區(qū)大規(guī)模推行的改土歸流，減少了大約80個土司。

但是，歷史上的發(fā)展從來都不是一帆風順的，如果改土歸流完全能夠和平地進行，那就不能拖到清朝才大規(guī)模推動了。

由于清朝的改土歸流規(guī)模大，引起了西南諸多土司的反抗，清朝便以武力平定，其中比較出名就有大小金川之戰(zhàn)、苗疆之疆、瞻對之戰(zhàn)等。而苗疆之戰(zhàn)，則是清朝在改土歸流中進行了最典型的戰(zhàn)爭。

改土歸流在貴州一帶遇到的阻力是最大的，這和貴州的特殊地理環(huán)境、歷史傳統(tǒng)和民族成分有關。在地理環(huán)境上，貴州溝壑縱橫，交通不便，中原王朝自古以來就是鞭長莫及。而貴州的民族成分非常復雜，除了苗族之外，還有大量的侗族、彝族等。

早在明朝時期，為了削弱貴州的土司，發(fā)動了“思州之戰(zhàn)”“播州之役”和“水東之役”，消滅了貴州高原上的三大土司。到清初，又消滅了水西土司，使得貴州的四大土司都成為了歷史。

然而，改土歸流在“苗疆”推進時，卻還是遇到了前所未有的阻力。

貴州是遏制西南的戰(zhàn)略要地，云貴總督鄂爾泰曾說

鄂爾泰黔治則有與之俱治者，黔亂則有與之俱亂”“若不改土歸流，三省交接皆受其擾。

因此，雍正帝對貴州的改土歸流非常堅決，不惜用重兵。

清朝將貴州新開辟出來的土地稱之為“苗疆”，或者“新疆”（是的雍正時期新疆是苗疆的稱呼，乾隆年間滅了準噶爾之后，才把準噶爾汗國的故土改名新疆，也就是今天的新疆。）。

從雍正六年到雍正十一年，清軍大舉進攻苗嶺“化外生苗”地區(qū)，最終設立了古州、臺拱、清江、都江、丹江、八寨六廳，合稱“新疆六廳”。

新開辟的土地規(guī)模非常大，“辟地二三千里，幾當貴州全省之半”。貴州是清朝在“改土歸流”中投入兵力最多，戰(zhàn)斗最激烈的地區(qū)。此后，清朝在黔東南駐扎了6000人，后來增加到了15000人。

然而，改土歸流破壞了當地苗族土司的利益，他們不愿意放棄自古以來的特權，因而蠢蠢欲動。而清朝在苗疆的治理也出現了一些問題，例如勒令“夷人”放棄祖?zhèn)鞯姆b發(fā)式，加重賦稅，土地兼并，加重社會矛盾。因此，苗亂就在復雜的社會背景下爆發(fā)了。

雍正十二年，貴州黎平人包利在古州以“苗王出世”號召苗民反清。第二年，官吏濫征錢糧，古州地區(qū)的八妹、高表等寨苗民蜂擁而起，聚眾2萬余人。古州總兵研勛率兵鎮(zhèn)壓，苗民大敗。于是包利又轉移到臺江，隊伍得以發(fā)展壯大。

隨后，貴州巡撫元展成、提督哈元生等下令古州、清江（劍河）的幾百清軍前往鎮(zhèn)壓。然而，苗民反而包圍了臺拱番招坉汛城。于是元展成調集5000人去解圍，結果在半路被苗民包圍。之后，苗民攻占了凱里、黃平、余慶等地，向鎮(zhèn)遠、思州等府推進。

事態(tài)發(fā)生后，雍正帝立即調動6省2萬余清軍進入貴州平叛。然而，清軍在貴州并未迅速平定叛亂，苗民趁機進攻清軍空虛的營寨，叛亂范圍涉及整個黔東南。

就在這個關鍵時候，雍正帝駕崩了。乾隆帝上臺。這是乾隆面對的第一個挑戰(zhàn)，他將平定苗亂作為當時最重要的事情，

弘歷苗疆用兵，乃目前第一要務。

當時，朝廷的許多大臣攻擊鄂爾泰，主張停止改土歸流，甚至提出放棄“苗疆”，。乾隆繼位后，首先將主張放棄苗疆的大臣張照拿下，給他安上一個“假傳圣旨”的大罪，說雍正帝“絕無放棄苗疆之意”。如此，朝廷大臣就不敢反對乾隆帝了。

隨后，乾隆任用湖廣總督張廣泗為貴州巡撫，總理苗疆事務，并將元展成、董芳、哈元生等革職拿問。為了規(guī)范清軍紀律，乾隆下令禁止清軍濫殺，提倡以德濟威，以爭取民心。在平叛方略上，采取先安熟苗，后搗生苗，再懲熟苗，各個擊破的戰(zhàn)術。

當年十二月，張廣泗在凱里兵分三路挺進苗疆，總兵力達到了1.2萬人。三路清軍以圍攻的方式對清江發(fā)動了進攻。在清軍的猛烈進攻下，苗民不斷失利。清軍在年底就攻破了幾十個較大的苗寨，苗民死傷慘重。

乾隆元年三月，清軍已經攻破了200座苗寨，包利被迫退守雷公山。

雷公山盤亙數百里，是貴州四大名山之一，這里地勢崎嶇、森林密布。包利將雷公山的道路挖斷，以圖據守。

張廣泗則扼守各個路口，然后四面搜剿。到四月，包利被俘，苗民士氣大落。五月，清軍結束了雷公山之戰(zhàn)。到九月，清軍平定了整個苗疆。

平定苗亂后，乾隆下令“永除新疆苗賦”，以安定苗疆。除此，乾隆還規(guī)定“一切自相爭訟之事，俱照苗例完結，不必繩以官法”，如此則為“以苗治苗”。

對于派遣到苗疆的官吏，乾隆必定嚴加審核，一定要選擇清官前往，以免激烈階級矛盾。乾隆還在貴州推行屯田政策，大大減輕了苗民的負擔。此后，苗疆平定了大約60年的時間。

改土歸流在苗疆得以順利推行。